אגף הייצוא הביטחוני (סיבט)אגף משאבי אנושפניות הציבור וחוק חופש המידעאגף דוברות וקשרי ציבוראגף ביטחוני-חברתיאגף משפחות והנצחהאגף ההנדסה והבינויאגף הפיקוח על הייצוא הביטחוני (אפ"י)אגף היועץ המשפטי למערכת הביטחוןאגף מבצעים לוגיסטיים ונכסיםאגף שיקום נכיםארכיון צהל ומערכת הביטחוןהאגף לחיילים משוחררים ומילואיםרשות מעברים יבשתייםמינהל ההרכשה והייצור (מנה"ר)מינהל המעבר דרומהמינהל פיתוח אמצעי לחימה ותשתית טכנולוגית (מפא"ת)רח"ל - רשות החירום הלאומיתמבקר מערכת הביטחון